Nebo taky z Thajska. To jsou dvě země, ve kterých bylo zpětně v sekvenačních databázích nalezeno nejvíce izolátů nově popsaného vysoce virulentního kmene karbapenem-rezistentní E. coli. Kmen, jeho fylogenetický vývoj a rozšíření popisuje originální článek týmu z Univerzit v Cambridge, Birminghamu a z čínských nemocnic/univerzit (plný text vhodný spíše pro mikrobiology se znalostí molekulární biologie najdete zde). V populárně stravitelné verzi na tato zjistění upozornil Health Hygiene Magazine zde. O co tedy jde? Karbapenem-rezistentní E. coli sama o sobě není nic neobvyklého a zvláštního. Problém je v tom, že virulence multirezistentních bakterií je obvykle nižší, než těch citlivých, mimo jiné proto, že na udržování a expresi genů pro rezistenci musí bakterie vynakládat více energie. Pro varianty rezistentní ke karbapenemům to platí obvykle ještě víc, než u jiných variant. Nová evoluční linie, která se vyvinula z karbapenem-rezistení E. coli sekvenčního typu 140 (ST-410 CREC), se množí rychleji a je virulentnější. Varianta je označována B5, konkrétně B5/H24RxC a od svého předka se liší tím, že jí chybí X3 plazmid nesoucí gen rezistence blaOXA-181, ale má navíc F plazmid nesoucí blaNDM-5. Většina izolátů také obsahuje genový ostrov pro vysokou patogenitu (high pathogenicity island) a nový genový klastr pro O-antigen.
Na základě komparativních genomových analýz sbírkových izolátů bylo možné dovodit, že linie vznikla už někdy kolem roku 2006, v Číně již způsobila dva závažné outbreaky v dětských nemocnicích a kontrolou sekvencí uložených v databázích bylo zjištěno, že se již rozšířila do mnoha dalších zemí (Austrálie, Bangladéš, Benin, Brazílie, Kambodža, Kanada, Česká republika - 1 izolát od prasete domácího, Dánsko, Etiopie, Francie, Gambie, Německo, Řecko, Maďarsko, Indie, Irsko, Izrael, Itálie, Japonsko, Keňa, Laos, Libanon, Madagaskar, Mexiko, Myanmar (Barma), Nepál, Nizozemí, Nový Zéland, Niger, Nigérie, Norsko, Omán, Pakistán, Polsko, Portugalsko, Katar, Rumunsko, Rwanda, Saudská Arábie, Singapur, Slovinsko, Jižní Korea, Španělsko, Švédsko, Švýcarsko, Tanzánie, UK, USA, Vietnam).
Comments